В Director's Cut вернули сексуальные сцены, вырезанные в остальных версиях. Сам же Indigo Prophecy — история об убийстве, где игрок поочерёдно управляет персонажами по обе стороны: предполагаемым убийцей и теми, кто его ищет. Повествование развивается через исследование локаций, разговоры и взаимодействие с окружением, а динамичные эпизоды требуют укладываться в таймеры и QTE.