Соник носится по зонам, которые существуют в трёх версиях — прошлом, настоящем и будущем, — и то, что герой изменит в прошлом, определяет облик будущего. Эта механика превращает скоростные забеги в исследование с экспериментами над временем и открывает путь к истинной концовке. Доктор Роботник, разумеется, тоже крутит время в своих целях.